93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3238 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 164 aa  330  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  83.54 
 
 		 164 aa  287  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  75.93 
 
 		 163 aa  263  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  53.64 
 
 		 165 aa  173  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  53.64 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  53.64 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  53.64 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  53.64 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  55.63 
 
 		 164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  52.98 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  53.64 
 
 		 165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  52.98 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  52.98 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  52.98 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  50.99 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  50.99 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  50.99 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  50.99 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  50.99 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  50.99 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  46.58 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  50.33 
 
 		 165 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  50.33 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  49.67 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  49.67 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  42.07 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  37.18 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  38.71 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  37.93 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  34.39 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  34.59 
 
 		 195 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  32.48 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  31.45 
 
 		 160 aa  91.3  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  31.45 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  32.08 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  30.19 
 
 		 166 aa  87.4  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  29.86 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  32.92 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  28.92 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  28.85 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  32.06 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  28.31 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  28.93 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  28.3 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  28.47 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  27.88 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  31.87 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  24.53 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  26.25 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  26.42 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  23.08 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  44.12 
 
 		 673 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 674 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  44.12 
 
 		 671 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 		 662 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  35.14 
 
 		 664 aa  50.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  36.51 
 
 		 720 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 		 684 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  30.84 
 
 		 336 aa  48.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 542 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  38.81 
 
 		 212 aa  47.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  25.74 
 
 		 352 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 335 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 335 aa  45.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  30.11 
 
 		 350 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 335 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 		 764 aa  44.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  37.88 
 
 		 221 aa  44.7  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 		 710 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  27.72 
 
 		 351 aa  43.9  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  41.27 
 
 		 313 aa  43.9  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 		 564 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  27.16 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  43.48 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 		 346 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  41.3 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  40.38 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  40.38 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 		 771 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  38.46 
 
 		 232 aa  41.6  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  39.62 
 
 		 544 aa  41.2  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 		 652 aa  40.8  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  35.14 
 
 		 217 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  38.89 
 
 		 332 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>