143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0356 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  39 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  41.62 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  34.52 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  32 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2149  regulatory protein GntR, HTH  31.75 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2291  GntR family transcription regulator  50 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000698422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 471 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  41.89 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  41.89 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  32.35 
 
 		 163 aa  51.6  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  41.89 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  41.89 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 470 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  33.82 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  42.42 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  42.42 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  34.78 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.26 
 
 		 470 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  41.27 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 251 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  29.41 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  38.67 
 
 		 243 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 470 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 470 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  31.65 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1491  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0628675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  31.43 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4236  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  27.18 
 
 		 568 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  40.35 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  40.35 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  28.38 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4955  putative transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  31.34 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  40.35 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  22.84 
 
 		 470 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1280  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000081725  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  39.66 
 
 		 544 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  31.94 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 300 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 250 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  31.94 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  23.36 
 
 		 263 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.44 
 
 		 258 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  31.94 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  31.94 
 
 		 236 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 		 674 aa  45.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  31.51 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  31.94 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  31.94 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  31.51 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  31.94 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  36.07 
 
 		 335 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  30.14 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  36.07 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  28 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  35.94 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  37.31 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.43 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  27.83 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  28.57 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4217  regulatory protein GntR, HTH  34.38 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.53296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 		 684 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  36.07 
 
 		 335 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  34.18 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>