42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1615 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  99.04 
 
 		 208 aa  411  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  39.7 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  31.84 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  29.85 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2149  regulatory protein GntR, HTH  29.89 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2291  GntR family transcription regulator  51.47 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000698422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 		 541 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  36.23 
 
 		 163 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  37.14 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  37.14 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 		 652 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  37.14 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  37.14 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  25.29 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  27.72 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  28.33 
 
 		 160 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 165 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  32.35 
 
 		 236 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  32.81 
 
 		 650 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  32.35 
 
 		 236 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  35.71 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  35.71 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  24.29 
 
 		 404 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  24.46 
 
 		 410 aa  41.6  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 		 664 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 165 aa  41.2  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>