22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0368 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  100 
 
 
404 aa  784    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  66 
 
 
401 aa  513  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  60.86 
 
 
405 aa  427  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  60 
 
 
405 aa  413  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  41.07 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  41.9 
 
 
410 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  40.77 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  41.01 
 
 
399 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  84.15 
 
 
310 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  40.05 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  39.33 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  35.09 
 
 
190 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 
214 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 
220 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  35.59 
 
 
212 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  36.07 
 
 
720 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  28.3 
 
 
219 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  38.18 
 
 
332 aa  43.5  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  38.18 
 
 
332 aa  43.5  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  38.46 
 
 
567 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 
665 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>