110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0119 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  322  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  95.78 
 
 		 196 aa  279  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  58.75 
 
 		 160 aa  183  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  56.33 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  57.59 
 
 		 160 aa  178  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  56.25 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  56.25 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  51.25 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  53.12 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  50 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  54.01 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  49.37 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  49.37 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  49.37 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  48.12 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  45 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  46.84 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  45.51 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  48 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  43.87 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  43.95 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 		 164 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  28.93 
 
 		 163 aa  88.2  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  28.93 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  25.32 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  31.21 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  34.64 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  26.45 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  27.1 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  26.45 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  26.45 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  26.45 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  26.45 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  26.45 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  28.12 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  28.67 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  28.67 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  28.67 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  28 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  26.67 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  26.67 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  32.45 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  28.93 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  28.3 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  27.52 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  26.71 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  38.67 
 
 		 720 aa  51.6  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  51.67 
 
 		 662 aa  51.2  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  31.87 
 
 		 90 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  31.87 
 
 		 90 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  35.44 
 
 		 90 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  30.95 
 
 		 401 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  40.54 
 
 		 544 aa  48.5  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  35.63 
 
 		 671 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 673 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  39.62 
 
 		 652 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  34.88 
 
 		 568 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 		 636 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 771 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  29.76 
 
 		 562 aa  44.7  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  35.94 
 
 		 405 aa  44.3  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  32.73 
 
 		 221 aa  44.3  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 		 542 aa  44.3  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 		 672 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  38.18 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 		 664 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  34.25 
 
 		 693 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  36.49 
 
 		 399 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 674 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  28.99 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  31.15 
 
 		 233 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  34.43 
 
 		 217 aa  42  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 220 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 220 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 		 658 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  29.89 
 
 		 371 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  23.19 
 
 		 335 aa  40.8  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  26.87 
 
 		 215 aa  40.8  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5710  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 		 679 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  35.29 
 
 		 221 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>