81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3109 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 162 aa  327  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  47.53 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  47.53 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  47.83 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  47.53 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  47.53 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  46.91 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  47.53 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  46.91 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  46.91 
 
 		 164 aa  163  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  46.91 
 
 		 164 aa  163  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  46.91 
 
 		 169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  46.91 
 
 		 169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  46.58 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  44.87 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  44.23 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  44.23 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  44.23 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  44.23 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  44.23 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  44.23 
 
 		 165 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  44.23 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  43.59 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  44.23 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  44.03 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  35 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  36.02 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  36.77 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  34.16 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  35 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  33.95 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  33.96 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  32.72 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  32.1 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  31.9 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 186 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  29.01 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  28.22 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  28.75 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  28.75 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  28.97 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  27.16 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  31.3 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  28.4 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  28.4 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  28.4 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  28.19 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  27.04 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  26.8 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  27.14 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  24.53 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  25.93 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  24.07 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 674 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  40.38 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  22.76 
 
 		 662 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 668 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  36.49 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  35.09 
 
 		 220 aa  44.7  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 614 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  26.88 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 652 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.47 
 
 		 350 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 		 336 aa  43.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  31.87 
 
 		 293 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.47 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 658 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  31.58 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 		 666 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 		 673 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 		 666 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  31.15 
 
 		 233 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  37.74 
 
 		 229 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  37.74 
 
 		 229 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 		 330 aa  40.8  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  33.93 
 
 		 544 aa  40.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 762 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  32.26 
 
 		 351 aa  40.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>