45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2691 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  36.24 
 
 		 159 aa  98.6  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  31.87 
 
 		 162 aa  97.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  29.19 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  32.72 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  25.83 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  27.03 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  26 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  27.03 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  27.03 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  25.81 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  25.81 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  26.61 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  26.61 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  26.61 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  25 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  25 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  25 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  25 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  23.27 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  28.03 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  29.25 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  22.01 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  24.67 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  22.92 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  25 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  26.85 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  27.21 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  25.47 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  30.52 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  24.84 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  23.93 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  25.5 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  29.58 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>