111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0860 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  330  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  43.51 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  38.22 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  38.71 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  36.77 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  35.58 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  36.65 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  35.48 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  33.95 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  33.95 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  32.3 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  34.84 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  34.19 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  34.19 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  34.19 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  35.95 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  35.95 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  35.95 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  34.19 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  35.95 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  35.95 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  35.48 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  35.95 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  35.29 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  35.29 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  34.19 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  35.29 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  34.19 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  30.43 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  34.62 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  28.93 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  29.56 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  26 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  27.85 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  33.83 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  27.78 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  27.67 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  29.88 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  28.93 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  27.67 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  30 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  26.54 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  26.97 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  26.99 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  30.13 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  27.22 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 		 667 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  24.18 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  34.72 
 
 		 720 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  39.13 
 
 		 671 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  39.13 
 
 		 673 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  35.53 
 
 		 341 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 		 662 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  23.75 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 674 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  38.71 
 
 		 355 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  38.57 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 		 666 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 684 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.33 
 
 		 697 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 		 656 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  30.56 
 
 		 402 aa  48.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  31.96 
 
 		 338 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 672 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  35.29 
 
 		 609 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  30.26 
 
 		 354 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 		 747 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 773 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5523  potassium channel, putative  34.72 
 
 		 107 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  35 
 
 		 672 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 		 335 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 		 335 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 		 332 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 362 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  36.36 
 
 		 741 aa  44.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 		 335 aa  44.3  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 741 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  34.72 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  27.17 
 
 		 665 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  32.86 
 
 		 664 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  27.17 
 
 		 665 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  33.33 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  34.72 
 
 		 334 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 		 636 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  27.38 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  35.29 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 		 371 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 668 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>