29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0931 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  100 
 
 
184 aa  367  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  42.13 
 
 
399 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  40.68 
 
 
410 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  43.27 
 
 
400 aa  131  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  38.89 
 
 
402 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  39.33 
 
 
404 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  36.81 
 
 
405 aa  114  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  36.36 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  34.44 
 
 
405 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  32.6 
 
 
190 aa  108  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  36.16 
 
 
401 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  31.29 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  45 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  45 
 
 
332 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
764 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  38.57 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
668 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.51 
 
 
663 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  32.47 
 
 
624 aa  45.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  37.33 
 
 
212 aa  45.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0703  TrkA-C domain protein  41.46 
 
 
256 aa  46.2  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.308951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  31.88 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  29.36 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0397  TrkA domain-containing protein  34.29 
 
 
96 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  28.8 
 
 
720 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5523  potassium channel, putative  31.96 
 
 
107 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  35.82 
 
 
605 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
339 aa  42  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  41.67 
 
 
215 aa  41.2  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>