96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3875 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  86.88 
 
 
160 aa  287  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  54.14 
 
 
159 aa  167  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  48.75 
 
 
160 aa  156  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  45 
 
 
160 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  43.75 
 
 
166 aa  141  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  45 
 
 
160 aa  140  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  43.95 
 
 
195 aa  139  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  44.38 
 
 
186 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  46.25 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  46.25 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  43.75 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  43.75 
 
 
160 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 
166 aa  131  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 
196 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  41.88 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  44.38 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  43.71 
 
 
161 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  41.45 
 
 
154 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  38.85 
 
 
161 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  28.48 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  27.04 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  24.84 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  34.64 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  25 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  28.67 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  29.05 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  24.53 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  28.67 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  28 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  28 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  27.81 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  28 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  27.81 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  27.81 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  27.81 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  27.81 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  28 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  27.81 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  28.3 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  26.97 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  26.53 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  26.53 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  29.33 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  24.84 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  27.16 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  40.35 
 
 
224 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  39.34 
 
 
652 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 
341 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 
693 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  34.67 
 
 
335 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  34.67 
 
 
335 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  43.14 
 
 
544 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 
676 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  35.94 
 
 
335 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  38.1 
 
 
664 aa  47.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  25.49 
 
 
162 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  35.48 
 
 
405 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  41.94 
 
 
338 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
672 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
214 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.82 
 
 
697 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 
674 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  44.44 
 
 
215 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  39.22 
 
 
227 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  41.82 
 
 
355 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  35.38 
 
 
354 aa  44.3  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  35 
 
 
662 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  36.36 
 
 
233 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  32.86 
 
 
667 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  38.64 
 
 
217 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  40 
 
 
544 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 
674 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  23.6 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  46.34 
 
 
777 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  32.58 
 
 
568 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 
764 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  32.14 
 
 
224 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  29.76 
 
 
90 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  41.82 
 
 
575 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
206 aa  41.6  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  31.88 
 
 
741 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  39.22 
 
 
673 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 
668 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  34.62 
 
 
351 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  37.93 
 
 
671 aa  40.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 
771 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>