96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1208 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  100 
 
 
166 aa  324  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  40.12 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  42.07 
 
 
164 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  37.58 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  41.03 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  37.58 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  37.58 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  41.46 
 
 
164 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  36.97 
 
 
165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  35 
 
 
162 aa  127  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  36.97 
 
 
164 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  36.97 
 
 
164 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  36.97 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  36.97 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  36.97 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  36.97 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  36.31 
 
 
165 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  36.31 
 
 
165 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  36.94 
 
 
165 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  36.94 
 
 
165 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  36.94 
 
 
165 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  36.94 
 
 
165 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  36.94 
 
 
165 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  36.31 
 
 
165 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  35.67 
 
 
165 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  35.67 
 
 
165 aa  120  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  39.24 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  34.39 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  33.95 
 
 
163 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  30.06 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  29.7 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  29.52 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  31.21 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  31.21 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  29.27 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  31.87 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  28.57 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  30.77 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  27.78 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  28.75 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  24.67 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  28.39 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  24.84 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  26.06 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  24.2 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  27.71 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  28.12 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  28.12 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  28.12 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 
217 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  25 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  26.32 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  37.18 
 
 
652 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  28.08 
 
 
160 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  40.24 
 
 
220 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  23.91 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  24.55 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  29.41 
 
 
234 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  35.62 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  28.18 
 
 
221 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  29.41 
 
 
234 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  27.78 
 
 
352 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  30.56 
 
 
220 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  30.56 
 
 
220 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  37.14 
 
 
541 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  30.11 
 
 
222 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.71 
 
 
350 aa  44.3  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  33.75 
 
 
400 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 
757 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  37.31 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  35.82 
 
 
222 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  30.39 
 
 
548 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.95 
 
 
350 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  28.17 
 
 
223 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  29.13 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.1 
 
 
350 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  34.78 
 
 
223 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
214 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  23.76 
 
 
232 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  29.13 
 
 
221 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.1 
 
 
350 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  31.25 
 
 
405 aa  41.6  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 
351 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  28.95 
 
 
346 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 
215 aa  41.2  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  27.45 
 
 
219 aa  40.8  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
684 aa  40.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>