114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0233 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 164 aa  333  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  64.42 
 
 		 169 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  64.42 
 
 		 169 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  63.8 
 
 		 165 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  63.8 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  63.8 
 
 		 164 aa  225  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  63.8 
 
 		 164 aa  225  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  63.8 
 
 		 165 aa  225  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  63.19 
 
 		 165 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  63.19 
 
 		 165 aa  223  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  65.22 
 
 		 165 aa  223  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  64.6 
 
 		 165 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  62.58 
 
 		 165 aa  221  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  63.35 
 
 		 165 aa  219  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  63.35 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  63.35 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  63.35 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  63.35 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  62.35 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  63.35 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  61.73 
 
 		 165 aa  217  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  60.13 
 
 		 163 aa  190  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  57.5 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  55.63 
 
 		 164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  44.03 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  40 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  41.03 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  32.68 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  37.74 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  34.18 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  33.12 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  31.76 
 
 		 195 aa  84  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  30.86 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  29.63 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  30.25 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  30.25 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  30.25 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  28.3 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  25.83 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  27.74 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  26.11 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  26.95 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  27.21 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  28.36 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  26.88 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  25.81 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  30.57 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  26.53 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  24.36 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  25.15 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  28.39 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  24.7 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 		 664 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  32.95 
 
 		 337 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  25.64 
 
 		 666 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  39.71 
 
 		 673 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  41.27 
 
 		 371 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  31 
 
 		 331 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 219 aa  48.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  29 
 
 		 346 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  39.29 
 
 		 771 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  27.55 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 665 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 762 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 659 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  36.51 
 
 		 399 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.98 
 
 		 624 aa  45.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  36.76 
 
 		 671 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 		 674 aa  45.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 		 233 aa  44.7  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  35.37 
 
 		 217 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 		 652 aa  44.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 351 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  24.37 
 
 		 674 aa  44.3  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  29.46 
 
 		 405 aa  44.3  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  32.5 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  27 
 
 		 354 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  36.59 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  25 
 
 		 620 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  30 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  34.25 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.65 
 
 		 632 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.43 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  35.59 
 
 		 668 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  26.88 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.32 
 
 		 332 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  26.67 
 
 		 572 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  26.67 
 
 		 622 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  26.79 
 
 		 614 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  26.97 
 
 		 90 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  30.26 
 
 		 213 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.49 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  26.36 
 
 		 650 aa  41.6  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 		 660 aa  41.6  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>