19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0734 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  811    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  58.31 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  47.79 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  47.8 
 
 		 410 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  44.86 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  42.22 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  41.25 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  40.05 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  39.64 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  37.57 
 
 		 190 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  38.89 
 
 		 184 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  41.36 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 		 671 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  30.56 
 
 		 163 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 214 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 673 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  43.64 
 
 		 609 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  34.78 
 
 		 165 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>