39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6030 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  54.55 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  54.55 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  50.63 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  41.98 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  39.77 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  38.64 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  36.05 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  38.64 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  36.36 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  34.88 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  36.05 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  32.58 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  37.88 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  39.06 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  35 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  31.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  31.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 165 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  30.3 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  31.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  31.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  30.3 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  22.73 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  26.97 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  30.3 
 
 		 165 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  30.3 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  30.3 
 
 		 165 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  30.3 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  30.3 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  30.3 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  30.3 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  30.3 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  28.79 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  30.3 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  30.34 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  28.79 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>