21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0790 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  100 
 
 
410 aa  827    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  72.04 
 
 
399 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  46.91 
 
 
400 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  47.3 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  47.8 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  41.9 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  41.37 
 
 
401 aa  296  5e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  43.37 
 
 
405 aa  294  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  42.11 
 
 
405 aa  290  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  44.2 
 
 
190 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  45.29 
 
 
310 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  40.68 
 
 
184 aa  137  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  39.34 
 
 
159 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  44.07 
 
 
667 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
214 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  42.37 
 
 
666 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  35.16 
 
 
227 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  29.57 
 
 
567 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  38.89 
 
 
215 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  41.82 
 
 
217 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  40.38 
 
 
581 aa  43.5  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>