44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0932 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  100 
 
 
190 aa  376  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  44.2 
 
 
410 aa  155  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  43.65 
 
 
400 aa  155  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  44.51 
 
 
399 aa  150  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  39.23 
 
 
399 aa  134  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  36.41 
 
 
405 aa  125  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  36.99 
 
 
405 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  36.99 
 
 
401 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  35.09 
 
 
404 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  37.57 
 
 
402 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  32.6 
 
 
184 aa  108  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  35.98 
 
 
310 aa  97.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  34.78 
 
 
332 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  34.78 
 
 
332 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  35.38 
 
 
605 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  34.25 
 
 
608 aa  51.2  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  38.81 
 
 
660 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  32.86 
 
 
161 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 
214 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  37.31 
 
 
213 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  27.63 
 
 
229 aa  45.1  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  32.86 
 
 
567 aa  44.7  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  38.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  38.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 
665 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 
664 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  38.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  38.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  38.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  38.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  22.56 
 
 
773 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  38.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  38.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  38.33 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  36.67 
 
 
221 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.59 
 
 
671 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  31.65 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  36.67 
 
 
221 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 
674 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  33.8 
 
 
337 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  31.18 
 
 
233 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  38.98 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  41.3 
 
 
764 aa  41.6  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  28.41 
 
 
581 aa  41.2  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>