24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1552 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 400 aa  800    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  58.31 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  48.59 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  46.91 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  44.1 
 
 		 399 aa  322  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  43.07 
 
 		 405 aa  302  7.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  40.3 
 
 		 405 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  40.77 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  40.21 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  43.65 
 
 		 190 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  41.45 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  43.27 
 
 		 184 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  40.68 
 
 		 581 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  39.39 
 
 		 332 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 201 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  41.07 
 
 		 668 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  37.88 
 
 		 332 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  33.87 
 
 		 159 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  26.79 
 
 		 161 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  33.75 
 
 		 166 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  27.1 
 
 		 160 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  39.68 
 
 		 693 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  33.73 
 
 		 212 aa  42.7  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>