22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0838 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  100 
 
 
405 aa  778    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  79 
 
 
405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  60.45 
 
 
401 aa  441  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  60 
 
 
404 aa  431  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  44.39 
 
 
399 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  43.37 
 
 
410 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  40.3 
 
 
400 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  41.25 
 
 
402 aa  275  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  40.2 
 
 
399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  66.47 
 
 
310 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  36.41 
 
 
190 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  35.26 
 
 
184 aa  122  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
214 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  32.81 
 
 
332 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  38.33 
 
 
591 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  32.81 
 
 
332 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  37.14 
 
 
161 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.29 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  32.08 
 
 
162 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  27.27 
 
 
219 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.28 
 
 
335 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  39.29 
 
 
664 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>