More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4217 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4217  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 346 aa  695    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.53296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4612  transcriptional regulator, GntR family  44.35 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4808  transcriptional regulator, GntR family  42.94 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3237  transcriptional regulator, GntR family  42.69 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3881  regulatory protein GntR HTH  40.7 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0954  transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 338 aa  249  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1116  regulatory protein GntR, HTH  34.29 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1999  regulatory protein GntR, HTH  33.24 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3120  regulatory protein GntR HTH  34 
 
 		 337 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3597  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.848461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5644  regulatory protein GntR HTH  29.75 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961176  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5298  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.278192  normal  0.0567929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  27.74 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  32.93 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  38 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  39.18 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  38 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  38 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  38 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  39.18 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4088  GntR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199409  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  30.48 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  37.25 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4240  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.5 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  30.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  35.14 
 
 		 126 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  40.28 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  29.52 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.07 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  36.49 
 
 		 483 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  36.49 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  36.49 
 
 		 480 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  27.84 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 160 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  27.84 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  32.22 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  27.84 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  27.55 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 243 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  34.25 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  27.55 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  27.84 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  27.55 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  29.52 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  29.52 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  23.91 
 
 		 246 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 120 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  30.91 
 
 		 231 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  27.7 
 
 		 231 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  27.7 
 
 		 231 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.77 
 
 		 139 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 128 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  34.25 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  34.25 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 133 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  27.84 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  34.25 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  30.91 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.14 
 
 		 473 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  34.25 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  30.39 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 		 121 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  28.87 
 
 		 234 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  26.76 
 
 		 231 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  30.39 
 
 		 231 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 478 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  30.39 
 
 		 231 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  30.39 
 
 		 231 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 476 aa  52.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  26.76 
 
 		 231 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 243 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 123 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 123 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  38.57 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  38.57 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>