More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0148 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  34.38 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 192 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 211 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  84.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  35.19 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  35.19 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 600 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  27.33 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 203 aa  50.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 212 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  34.78 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 418 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  21.02 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  25.22 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 243 aa  48.9  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>