More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2226 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2226  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 328 aa  629  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.91 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.51 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  42.07 
 
 		 322 aa  250  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.31 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.19 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  38.92 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  35.67 
 
 		 332 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  33.54 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.77 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  33.23 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  34.18 
 
 		 411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  33.13 
 
 		 462 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  33.54 
 
 		 410 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  34.49 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  33.54 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  34.84 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  32.84 
 
 		 416 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  32.84 
 
 		 416 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  32.84 
 
 		 416 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  35.26 
 
 		 449 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1073  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.91 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  33.55 
 
 		 413 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  34.45 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  34.01 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  34.01 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  34.01 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  34.01 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  34.01 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  34.01 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  34.01 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5972  NADH dehydrogenase (quinone)  36.48 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723565  normal  0.842062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  32.79 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  33.67 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  33.67 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  33.97 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  32.59 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  32.25 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  30.51 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  33.23 
 
 		 372 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.78 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 		 440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  33.44 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  32.48 
 
 		 384 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  31.33 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  32.27 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.63 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  33.22 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0747  NADH dehydrogenase (quinone)  32.52 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  34.08 
 
 		 447 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 372 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  30 
 
 		 353 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.78 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 		 486 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 		 353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  30 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  30.07 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  34.12 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  30.77 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  32.44 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.21 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  30.28 
 
 		 441 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0266  NADH dehydrogenase (quinone)  29.43 
 
 		 419 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571273  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  32.9 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  31.97 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  29.1 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.03 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  32.53 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  28.62 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.36 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  32.42 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  30.89 
 
 		 372 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 		 436 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  31.92 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0889  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.21 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  30.94 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  30.94 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  31.13 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  34.28 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  28.33 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  31.79 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  29.65 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  31.21 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.33 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  30.57 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.72 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  28 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.59 
 
 		 344 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000000126936  hitchhiker  0.00000000866182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  28 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  29.87 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  31.44 
 
 		 441 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3616  NADH dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 		 361 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.537864  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  30.74 
 
 		 372 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  31.85 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>