More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0274 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 
451 aa  887    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  62.72 
 
 
438 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  59.23 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  69.34 
 
 
486 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  61.79 
 
 
430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  60.44 
 
 
416 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  60.44 
 
 
416 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  60.44 
 
 
416 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  59.55 
 
 
410 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  61.01 
 
 
411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  66.67 
 
 
462 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  56.9 
 
 
413 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  55.48 
 
 
472 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  54.55 
 
 
452 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  63.51 
 
 
449 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  65.8 
 
 
447 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  56.58 
 
 
447 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  56.46 
 
 
449 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  63.34 
 
 
452 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  57.69 
 
 
448 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  53.29 
 
 
447 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  54.96 
 
 
458 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  62.57 
 
 
466 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  62.54 
 
 
448 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  51.47 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  54.84 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  62.96 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  53.79 
 
 
436 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  60 
 
 
457 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  53.37 
 
 
445 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  48.59 
 
 
420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  52.01 
 
 
341 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  49.56 
 
 
364 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  47.59 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.59 
 
 
349 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  50.79 
 
 
348 aa  319  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  47.77 
 
 
349 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  47.34 
 
 
415 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.53 
 
 
337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  51.75 
 
 
329 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.85 
 
 
330 aa  309  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.26 
 
 
389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  49.54 
 
 
330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.22 
 
 
344 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  49.53 
 
 
317 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.16 
 
 
348 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  47.84 
 
 
322 aa  300  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.43 
 
 
329 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.43 
 
 
337 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.27 
 
 
330 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  45.57 
 
 
342 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.67 
 
 
331 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.62 
 
 
343 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  48.02 
 
 
353 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
417 aa  293  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.12 
 
 
354 aa  292  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  46.81 
 
 
353 aa  292  7e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  47.11 
 
 
353 aa  292  8e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  47.99 
 
 
329 aa  292  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.53 
 
 
339 aa  292  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.26 
 
 
340 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 
369 aa  291  1e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  46.8 
 
 
352 aa  292  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.65 
 
 
340 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  43.41 
 
 
345 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  47.78 
 
 
338 aa  289  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  42.99 
 
 
367 aa  289  8e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  48.41 
 
 
341 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  48.41 
 
 
341 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  47.26 
 
 
343 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.4 
 
 
340 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  47.4 
 
 
340 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  45.64 
 
 
349 aa  286  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.81 
 
 
349 aa  285  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  49.4 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.48 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  44.82 
 
 
357 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.83 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  50.34 
 
 
323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  49.66 
 
 
317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  43.64 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  48.05 
 
 
354 aa  282  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  49.32 
 
 
319 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 
390 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.11 
 
 
366 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  44.15 
 
 
391 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.67 
 
 
337 aa  279  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  47.08 
 
 
341 aa  279  8e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  44.23 
 
 
354 aa  279  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  44.79 
 
 
354 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.29 
 
 
329 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  44.51 
 
 
354 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  46.93 
 
 
333 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  44.91 
 
 
322 aa  276  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  46.22 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  47.74 
 
 
333 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  47.74 
 
 
333 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  48.06 
 
 
333 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  47.74 
 
 
333 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  47.74 
 
 
333 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>