More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7012 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 345 aa  696    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  68.53 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  67.16 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  67.06 
 
 		 359 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  66.37 
 
 		 345 aa  458  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  60.97 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  49.54 
 
 		 349 aa  322  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.94 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.79 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  48.04 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.84 
 
 		 337 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  49.09 
 
 		 364 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  45.32 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.79 
 
 		 329 aa  305  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.55 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.9 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  45.9 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  44.34 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  48.66 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  44.79 
 
 		 341 aa  292  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.85 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  49.03 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  43.41 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.95 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  43.06 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 		 391 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.27 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.37 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  45.03 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.72 
 
 		 389 aa  282  5.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  49.36 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  44.97 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  45.89 
 
 		 417 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  43.02 
 
 		 462 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 447 aa  279  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 		 466 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  44 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.32 
 
 		 344 aa  275  9e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  44.51 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.9 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  43.93 
 
 		 486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  43.54 
 
 		 411 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  44.05 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.25 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  43.79 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  44.76 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  42.49 
 
 		 357 aa  268  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  41.11 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  42.23 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  41.35 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0479  NADH dehydrogenase (quinone)  40.37 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  41.74 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  41.4 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  41.81 
 
 		 413 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  42.41 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  42.6 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  43.15 
 
 		 441 aa  265  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  42.04 
 
 		 458 aa  265  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  40.52 
 
 		 438 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.66 
 
 		 339 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  43.04 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  42.3 
 
 		 441 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  43.89 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  40.76 
 
 		 384 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.6 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  40 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  40 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.08 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  42.6 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  41.69 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  41.69 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  41.69 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  40.62 
 
 		 372 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  43.77 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  42.01 
 
 		 372 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  41.46 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  41.77 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  42.39 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  43.44 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  44.27 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1522  NADH dehydrogenase subunit H  42.47 
 
 		 330 aa  257  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000672667  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  41.36 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.74 
 
 		 329 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  41.44 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  42.04 
 
 		 353 aa  255  6e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  45.19 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  41.07 
 
 		 318 aa  256  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  41.98 
 
 		 372 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  40.38 
 
 		 338 aa  255  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.98 
 
 		 337 aa  255  9e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  44.23 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  44.23 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  41.67 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  44.48 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  44.23 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  44.23 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1693  NADH dehydrogenase subunit H  45.02 
 
 		 348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  44.23 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>