More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1661 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 322 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  55.93 
 
 		 349 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  55.69 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  55.69 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  57.14 
 
 		 348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.83 
 
 		 337 aa  361  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  52.99 
 
 		 364 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  50.15 
 
 		 341 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.04 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.64 
 
 		 343 aa  325  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  51.78 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  52.1 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  50.17 
 
 		 341 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  50.17 
 
 		 341 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  51.95 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  50.62 
 
 		 354 aa  309  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 338 aa  309  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  52.15 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  49.38 
 
 		 330 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  48.39 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  50.93 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.3 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  50.93 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  48.39 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  52.15 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  52.15 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  52.15 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  52.15 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  52.15 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  52.15 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  51.82 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  52.15 
 
 		 333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  52.15 
 
 		 333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.06 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.27 
 
 		 357 aa  305  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  52.48 
 
 		 333 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  49.52 
 
 		 349 aa  305  9.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  51.49 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  47.15 
 
 		 451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.36 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  51.58 
 
 		 357 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  52.16 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  48.05 
 
 		 410 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  47.42 
 
 		 353 aa  301  9e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  49.24 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  49.37 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  46.85 
 
 		 411 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  50.16 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  48.11 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  48.11 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  48.43 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  48.11 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  48.11 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  48.01 
 
 		 354 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  48.11 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  48.11 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  48.11 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.38 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  49.84 
 
 		 354 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  46.45 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  50.16 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  46.13 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  50.16 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  50.16 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  48.19 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.13 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  49.84 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  50.77 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  50.77 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.91 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  45.35 
 
 		 416 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  45.35 
 
 		 416 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  45.35 
 
 		 416 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  46.75 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  48.9 
 
 		 336 aa  295  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  49.19 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  46.37 
 
 		 352 aa  294  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 		 438 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  46.89 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.13 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  46.89 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  51.47 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  46.89 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  48.18 
 
 		 364 aa  292  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  50.84 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  46.76 
 
 		 341 aa  292  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  50.84 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  50.84 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  47.84 
 
 		 352 aa  292  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.19 
 
 		 349 aa  291  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  47.15 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.74 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  45.26 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  46.2 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  46.2 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  46.84 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  46.2 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  49.03 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>