More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1308 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
354 aa  702    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  53.35 
 
 
341 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  51.44 
 
 
349 aa  348  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  51.15 
 
 
364 aa  343  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  51.01 
 
 
349 aa  342  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  51.01 
 
 
349 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.83 
 
 
337 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  51.37 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.99 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  49.69 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  50 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  50 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
486 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  50 
 
 
416 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.14 
 
 
389 aa  318  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.87 
 
 
329 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  49.12 
 
 
451 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  48.44 
 
 
447 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  48.83 
 
 
438 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  47.28 
 
 
330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  48.7 
 
 
447 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.15 
 
 
330 aa  309  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
449 aa  309  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  49.4 
 
 
430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  46.86 
 
 
458 aa  308  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  48.5 
 
 
353 aa  308  9e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  49.13 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.22 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  46.36 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  47.71 
 
 
330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  48.51 
 
 
411 aa  305  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  46.74 
 
 
329 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  47.26 
 
 
413 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  47.67 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  45.27 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  47.08 
 
 
433 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  47.31 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  47.01 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.99 
 
 
344 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.45 
 
 
339 aa  302  6.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  48.66 
 
 
410 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  46.48 
 
 
445 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  46.18 
 
 
359 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  43.87 
 
 
345 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.31 
 
 
339 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.57 
 
 
349 aa  298  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  45.83 
 
 
452 aa  298  9e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  47.31 
 
 
367 aa  298  9e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  46.53 
 
 
342 aa  298  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  48.8 
 
 
441 aa  298  9e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  47.77 
 
 
369 aa  298  1e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  46.83 
 
 
420 aa  297  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.35 
 
 
337 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  46.35 
 
 
384 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  48.96 
 
 
436 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  48.64 
 
 
447 aa  295  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  47.23 
 
 
415 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.29 
 
 
343 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  46.63 
 
 
357 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  43.89 
 
 
448 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  44.63 
 
 
357 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.35 
 
 
357 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  46.84 
 
 
472 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  47.43 
 
 
466 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  45.54 
 
 
350 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  41.81 
 
 
354 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  40.96 
 
 
354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  41.62 
 
 
354 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  41.13 
 
 
354 aa  288  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  45.04 
 
 
354 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  41.62 
 
 
354 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.27 
 
 
337 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  45.14 
 
 
349 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  45.43 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.59 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  44.84 
 
 
341 aa  285  8e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  45.76 
 
 
341 aa  285  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  46.08 
 
 
340 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.08 
 
 
340 aa  285  8e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  46.84 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.54 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  45.13 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  45.13 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 
457 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 
354 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 
352 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 
352 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 
354 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 
354 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 
352 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  43.75 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  45.65 
 
 
448 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  45.13 
 
 
355 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.41 
 
 
341 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.41 
 
 
341 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 
317 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  48.82 
 
 
449 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  44.35 
 
 
318 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>