More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0881 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
336 aa  659    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  57.59 
 
 
348 aa  382  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0749  NADH dehydrogenase (quinone)  54.63 
 
 
337 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0374707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  50.94 
 
 
329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  50.81 
 
 
322 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.1 
 
 
329 aa  295  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  48.68 
 
 
341 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  46.73 
 
 
330 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  50.17 
 
 
328 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  49.34 
 
 
353 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.54 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.08 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  48.84 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  44.25 
 
 
349 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  44.41 
 
 
349 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  49.67 
 
 
329 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  44.54 
 
 
349 aa  281  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.34 
 
 
330 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  48.68 
 
 
353 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  49.01 
 
 
330 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  45.72 
 
 
364 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.42 
 
 
331 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.41 
 
 
348 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  42.99 
 
 
415 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  43.37 
 
 
417 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.44 
 
 
339 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  41.49 
 
 
345 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.2 
 
 
337 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  43.49 
 
 
466 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  40.13 
 
 
350 aa  255  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.64 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.16 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  45.93 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  45.81 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.74 
 
 
343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  42.9 
 
 
441 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.09 
 
 
349 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  46.3 
 
 
333 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  42.64 
 
 
352 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  44.1 
 
 
486 aa  252  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  42.53 
 
 
357 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  44.77 
 
 
333 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.46 
 
 
344 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  44.09 
 
 
317 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.02 
 
 
341 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  45.02 
 
 
341 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  41.69 
 
 
354 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  41.8 
 
 
340 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  40.13 
 
 
413 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  42.11 
 
 
340 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  43.54 
 
 
354 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  42.02 
 
 
420 aa  248  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 
322 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  41.99 
 
 
354 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  41.9 
 
 
433 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  41.99 
 
 
354 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.28 
 
 
358 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  39.82 
 
 
451 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  41.23 
 
 
354 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  43.12 
 
 
410 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  43.63 
 
 
411 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  40.12 
 
 
448 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.21 
 
 
389 aa  245  6e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  45.6 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  45.6 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  42.2 
 
 
447 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  45.28 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  43.3 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  44.04 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.72 
 
 
339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  40.68 
 
 
472 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  41.92 
 
 
341 aa  243  3e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  41.76 
 
 
367 aa  243  3e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  41.06 
 
 
458 aa  242  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  41.62 
 
 
349 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  43.03 
 
 
357 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  42.51 
 
 
452 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  42.77 
 
 
352 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  42.67 
 
 
448 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  43.21 
 
 
384 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  45.95 
 
 
355 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.72 
 
 
357 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  44.55 
 
 
354 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  45.95 
 
 
355 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  45.95 
 
 
355 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  44.24 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  44.24 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  44.65 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  44.24 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  42.49 
 
 
438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  44.24 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>