More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0758 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
348 aa  678    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0749  NADH dehydrogenase (quinone)  57.06 
 
 
337 aa  394  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0374707  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  56.02 
 
 
336 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  44.99 
 
 
341 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.06 
 
 
329 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  42.82 
 
 
349 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  42.53 
 
 
349 aa  279  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  47.04 
 
 
328 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  43.67 
 
 
348 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  44.44 
 
 
330 aa  275  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.37 
 
 
337 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.13 
 
 
329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  46.69 
 
 
322 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 
349 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.43 
 
 
330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  45.12 
 
 
330 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  43.39 
 
 
364 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  41.44 
 
 
447 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  43.7 
 
 
329 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  45.34 
 
 
353 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.6 
 
 
329 aa  255  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  43.07 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.69 
 
 
353 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.05 
 
 
337 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  41.44 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.87 
 
 
331 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  44.69 
 
 
353 aa  252  6e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.36 
 
 
348 aa  252  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 
359 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  42.77 
 
 
341 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  42.77 
 
 
341 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  40.36 
 
 
433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  43.53 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 
333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  40.42 
 
 
451 aa  246  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 
333 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  40.73 
 
 
345 aa  245  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  43.26 
 
 
340 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  41.02 
 
 
441 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
466 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 
333 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.86 
 
 
343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  42.68 
 
 
340 aa  243  5e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.87 
 
 
344 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  40.72 
 
 
486 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  37.77 
 
 
350 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  41.85 
 
 
333 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 
430 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  42.51 
 
 
341 aa  238  1e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  43.24 
 
 
333 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  38.39 
 
 
417 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  41.44 
 
 
411 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  43.07 
 
 
372 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0145  NADH dehydrogenase (quinone)  41.88 
 
 
330 aa  236  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000869539  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  42.17 
 
 
372 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  39.82 
 
 
410 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  41.02 
 
 
416 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  41.02 
 
 
416 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  41.02 
 
 
416 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  43.4 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  43.4 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  39.69 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  39.64 
 
 
369 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.17 
 
 
354 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
357 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  40.06 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  42.05 
 
 
458 aa  233  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.86 
 
 
339 aa  232  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  39.72 
 
 
391 aa  232  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 
352 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  43.54 
 
 
384 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  39.41 
 
 
413 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  40.53 
 
 
367 aa  231  1e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  40.96 
 
 
384 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  42.77 
 
 
349 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  39.04 
 
 
390 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  39.34 
 
 
415 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  37.17 
 
 
438 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.54 
 
 
349 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.3 
 
 
366 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  40 
 
 
449 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.14 
 
 
347 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  41.87 
 
 
358 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  40.06 
 
 
372 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  40.94 
 
 
447 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  40.3 
 
 
372 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  39.63 
 
 
472 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  40.3 
 
 
372 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  41.92 
 
 
318 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1663  NADH dehydrogenase subunit H  39.22 
 
 
331 aa  226  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.418562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  39.76 
 
 
354 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  43.89 
 
 
338 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>