More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 441 aa  873    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  63.9 
 
 		 447 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  55.86 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  64.31 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  50.63 
 
 		 486 aa  441  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  55.63 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  54.29 
 
 		 416 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  55.86 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  55.45 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  54.05 
 
 		 416 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  56.69 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  57.47 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  54.05 
 
 		 416 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  55.63 
 
 		 449 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  57.46 
 
 		 410 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  55.34 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  49.55 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  52.33 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  51.92 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  52.57 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  48.74 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  49.54 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  52.79 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  49.1 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  49.11 
 
 		 452 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  56.4 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  53.35 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  52.79 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  55.52 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  51.11 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.92 
 
 		 344 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.43 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  50.31 
 
 		 420 aa  310  4e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  49.68 
 
 		 341 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  48.88 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.38 
 
 		 348 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.6 
 
 		 349 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  49.55 
 
 		 352 aa  306  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  46.99 
 
 		 390 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  51.29 
 
 		 341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  51.29 
 
 		 341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.26 
 
 		 357 aa  303  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.39 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  49.26 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  46.63 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.06 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.66 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  47.45 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  46.4 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.61 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.1 
 
 		 337 aa  296  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.54 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  46.39 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  44.48 
 
 		 357 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  45.08 
 
 		 417 aa  292  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.94 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.11 
 
 		 366 aa  289  6e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  46.76 
 
 		 354 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  46.76 
 
 		 354 aa  289  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  45.88 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  49.36 
 
 		 340 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.72 
 
 		 349 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  45.63 
 
 		 415 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  49.36 
 
 		 340 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  48.95 
 
 		 354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  46.02 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  48.95 
 
 		 354 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  48.95 
 
 		 354 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  48.95 
 
 		 354 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  48.95 
 
 		 333 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  48.95 
 
 		 352 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.36 
 
 		 354 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  48.95 
 
 		 352 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  48.95 
 
 		 352 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  47.4 
 
 		 341 aa  286  8e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  46.04 
 
 		 330 aa  286  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  46.71 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.68 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  49.54 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.47 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  46.2 
 
 		 354 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  46.93 
 
 		 322 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  49.38 
 
 		 355 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.67 
 
 		 331 aa  282  7.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.04 
 
 		 329 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  44.84 
 
 		 352 aa  282  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.18 
 
 		 330 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  46.78 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.93 
 
 		 340 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  48.77 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  49.19 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  47.02 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  48.77 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  47.88 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  49.5 
 
 		 343 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  48.75 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  48.92 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  49.69 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  48.77 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.78 
 
 		 359 aa  279  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>