More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0546 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 445 aa  894    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  75.06 
 
 		 447 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  71.23 
 
 		 458 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  68.48 
 
 		 436 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  65.89 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  57.31 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  55.18 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  52.14 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  53.16 
 
 		 433 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  54.03 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  55.15 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  54.15 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  55.19 
 
 		 438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  54.15 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  54.15 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  55.23 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  59.54 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  50.11 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  48.54 
 
 		 486 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  50.45 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  52.44 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  50 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  52.41 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  54 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  47.43 
 
 		 448 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  48.45 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  48.94 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  48.76 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  50.23 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  47.68 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  46.96 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  48.74 
 
 		 341 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.94 
 
 		 389 aa  284  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  43.9 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  46.87 
 
 		 349 aa  282  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  46.87 
 
 		 349 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  44.41 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  44.91 
 
 		 341 aa  280  4e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.48 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  44.55 
 
 		 367 aa  279  8e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.04 
 
 		 348 aa  278  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.51 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  46.9 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.89 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.09 
 
 		 337 aa  276  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.58 
 
 		 343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.81 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.23 
 
 		 329 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.31 
 
 		 349 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.48 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  43.17 
 
 		 415 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  45.07 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  43.44 
 
 		 338 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  45.81 
 
 		 390 aa  266  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  44.97 
 
 		 354 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  46.53 
 
 		 330 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  42.44 
 
 		 354 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.76 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 		 353 aa  262  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.2 
 
 		 331 aa  259  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.4 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  44.98 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  43.71 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  43.16 
 
 		 355 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  44.44 
 
 		 353 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  42.01 
 
 		 354 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 		 341 aa  257  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  42.6 
 
 		 355 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  42.6 
 
 		 355 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  43.86 
 
 		 353 aa  255  9e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  43.16 
 
 		 355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.06 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  45.12 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  45.16 
 
 		 357 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  41.18 
 
 		 354 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  41.18 
 
 		 354 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.73 
 
 		 348 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  41.18 
 
 		 354 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  41.18 
 
 		 354 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  41.18 
 
 		 352 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  41.18 
 
 		 352 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  41.18 
 
 		 352 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  41.42 
 
 		 333 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  44.03 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.62 
 
 		 357 aa  249  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  41.62 
 
 		 357 aa  249  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  43.03 
 
 		 345 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.51 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  42.17 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  41.14 
 
 		 339 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  40.99 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.4 
 
 		 347 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  45.19 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  43.14 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  42.06 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  40.46 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>