More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4456 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  95.09 
 
 		 447 aa  827    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 448 aa  883    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  62.5 
 
 		 447 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  58.09 
 
 		 486 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  56.75 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  53.64 
 
 		 438 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  53.85 
 
 		 448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  53.85 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  52.93 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  55.13 
 
 		 410 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  53.64 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  53.29 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  56.49 
 
 		 411 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  53.29 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  54.71 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  52.75 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  55.45 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  53.09 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  51.02 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  55.56 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  51.91 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  54.52 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  51.76 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  50.22 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  48.75 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  56.42 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  53.18 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  48.65 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  55.06 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  50.59 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  46.17 
 
 		 420 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.56 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  47.56 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.11 
 
 		 364 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.23 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.92 
 
 		 348 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.09 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  49.84 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.07 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  42.32 
 
 		 369 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  44.99 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.28 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.35 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  46.82 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  43.86 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  44 
 
 		 415 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.35 
 
 		 329 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  46.53 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  41.38 
 
 		 367 aa  280  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.19 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  44.09 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  45.82 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  44.92 
 
 		 338 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  43.9 
 
 		 357 aa  276  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  44.14 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.84 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.69 
 
 		 349 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  47.37 
 
 		 329 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  42.42 
 
 		 358 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  46.86 
 
 		 322 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  43.1 
 
 		 354 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.72 
 
 		 331 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.23 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  44.58 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  43.1 
 
 		 357 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  44.89 
 
 		 354 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  44.89 
 
 		 354 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1290  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.11 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  44.79 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.82 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  41.33 
 
 		 352 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.73 
 
 		 336 aa  268  2e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  44.02 
 
 		 348 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  44 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  41.21 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  44.97 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  44.54 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  42.2 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.06 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  44.25 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  44.25 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  44.25 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  44.25 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  44.25 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.55 
 
 		 359 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  44.25 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  43.52 
 
 		 333 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 		 347 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  44.14 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  42.46 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 		 342 aa  262  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  43.36 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  40.45 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  42.9 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.77 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  43.94 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>