More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2688 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 
452 aa  905    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  72.42 
 
 
457 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  61.58 
 
 
438 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  57.99 
 
 
448 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  61.94 
 
 
410 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  57.39 
 
 
452 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  59.51 
 
 
472 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  60.95 
 
 
411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  59.08 
 
 
433 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  58.52 
 
 
430 aa  465  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  57.28 
 
 
416 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  57.28 
 
 
416 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  57.28 
 
 
416 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  55.72 
 
 
413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  59.05 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  60.39 
 
 
462 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  54.04 
 
 
486 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  63.34 
 
 
451 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  53.16 
 
 
447 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  54.67 
 
 
449 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  55.85 
 
 
466 aa  418  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  54.17 
 
 
447 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  50.88 
 
 
447 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  55.25 
 
 
447 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  52.84 
 
 
441 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  53.71 
 
 
458 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  50.55 
 
 
448 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  61.23 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  50.9 
 
 
436 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  52.3 
 
 
445 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  50.15 
 
 
420 aa  323  5e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  50.15 
 
 
364 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  48.37 
 
 
341 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  48.83 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.83 
 
 
349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.31 
 
 
337 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.95 
 
 
337 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.28 
 
 
343 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.81 
 
 
389 aa  292  7e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.3 
 
 
348 aa  292  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  45.56 
 
 
349 aa  292  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.02 
 
 
329 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.85 
 
 
344 aa  289  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  48.21 
 
 
330 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  45.32 
 
 
354 aa  286  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  46.93 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  42.64 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  46.63 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  44.48 
 
 
338 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  42.24 
 
 
367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  43.87 
 
 
354 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  43.91 
 
 
354 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.69 
 
 
354 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  45.24 
 
 
352 aa  282  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  43.79 
 
 
354 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  43.79 
 
 
354 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.51 
 
 
341 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  45.82 
 
 
322 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.51 
 
 
341 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  45.4 
 
 
354 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  41.06 
 
 
415 aa  281  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  44.87 
 
 
348 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.72 
 
 
329 aa  280  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  44.01 
 
 
341 aa  279  6e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  44.48 
 
 
417 aa  279  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  46.46 
 
 
317 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  43.22 
 
 
349 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  45.13 
 
 
341 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.4 
 
 
347 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  45.23 
 
 
354 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  46.71 
 
 
390 aa  276  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  45.23 
 
 
354 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  45.3 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.78 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  44 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 
354 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  43.69 
 
 
355 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.94 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 
355 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 
355 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  42.54 
 
 
357 aa  273  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.87 
 
 
339 aa  273  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.82 
 
 
331 aa  272  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 
358 aa  272  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.41 
 
 
366 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  44.83 
 
 
329 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.4 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  46.86 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  44.34 
 
 
337 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  45.75 
 
 
342 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  44.13 
 
 
355 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  44.13 
 
 
355 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  44.13 
 
 
355 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>