More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1870 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 417 aa  824    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  69.13 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.3 
 
 		 389 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  47.09 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  48.82 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  46.48 
 
 		 462 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  45.98 
 
 		 458 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  48.45 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  49.38 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  48.55 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  45.26 
 
 		 451 aa  296  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  46.92 
 
 		 436 aa  296  6e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  45.77 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  52.12 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  48.53 
 
 		 410 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  44.5 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  49.7 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  46.83 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.13 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  47.35 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  48.2 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  47.35 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  47.67 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  53.57 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  53.57 
 
 		 330 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  48.38 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  43.09 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  44.2 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  49.85 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  46.29 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.59 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  47.38 
 
 		 430 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.06 
 
 		 329 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  46.01 
 
 		 486 aa  282  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  47.29 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  45.89 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  51.92 
 
 		 329 aa  279  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  46.9 
 
 		 445 aa  279  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 		 367 aa  277  3e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  42.13 
 
 		 413 aa  276  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  46.87 
 
 		 391 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  46.94 
 
 		 449 aa  275  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  43.12 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  46.69 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  46.48 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  43.73 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  46.75 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.69 
 
 		 337 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  46.94 
 
 		 341 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  44.21 
 
 		 447 aa  272  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  42.15 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  44.72 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  42.81 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  43.97 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  44.72 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  45 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  43.47 
 
 		 338 aa  270  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  46.44 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.66 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.03 
 
 		 343 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 		 335 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  46.95 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  44.16 
 
 		 335 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  44.16 
 
 		 335 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  44.16 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  46.13 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  43.85 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  40.97 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  44.16 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  43.53 
 
 		 335 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  46.2 
 
 		 353 aa  260  4e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  44.51 
 
 		 336 aa  259  4e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  41.97 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2418  NADH dehydrogenase subunit H  43.47 
 
 		 330 aa  259  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.68011  normal  0.208608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  42.99 
 
 		 349 aa  259  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  47.92 
 
 		 319 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  41.49 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  46.98 
 
 		 420 aa  256  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  44.88 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  40.96 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  40.67 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.55 
 
 		 353 aa  255  9e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  39.3 
 
 		 354 aa  255  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  39.88 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  41.49 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  39.88 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  42.68 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  42.38 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  42.6 
 
 		 457 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  42.33 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  42.33 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  43.3 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  42.33 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  42.33 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  42.33 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  42.07 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  38.22 
 
 		 354 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  40.9 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  42.02 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>