More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0916 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
389 aa  753    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  61.32 
 
 
417 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  61.49 
 
 
415 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  50.29 
 
 
486 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  49.11 
 
 
349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  50.6 
 
 
341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  50.78 
 
 
447 aa  309  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.11 
 
 
349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  48.2 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  51.26 
 
 
451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  48.84 
 
 
364 aa  301  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  51.7 
 
 
413 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  48.08 
 
 
436 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  52.81 
 
 
447 aa  300  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  50.14 
 
 
410 aa  299  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  49.53 
 
 
458 aa  299  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  45.33 
 
 
433 aa  299  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  50.87 
 
 
357 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.37 
 
 
348 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.14 
 
 
354 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  52.48 
 
 
430 aa  295  7e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  47.16 
 
 
416 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  47.16 
 
 
416 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  48.77 
 
 
416 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.37 
 
 
337 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  50.89 
 
 
330 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.85 
 
 
330 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  49.85 
 
 
447 aa  292  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  49.56 
 
 
330 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  49.84 
 
 
441 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  50.78 
 
 
411 aa  289  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  48.39 
 
 
390 aa  288  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  47.83 
 
 
438 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  47.92 
 
 
391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.69 
 
 
329 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  49.21 
 
 
449 aa  286  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.31 
 
 
349 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  44.95 
 
 
335 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  50.84 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  48.2 
 
 
341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.63 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  46.94 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  45.72 
 
 
345 aa  283  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  47.81 
 
 
407 aa  282  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  43.15 
 
 
452 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  48.84 
 
 
448 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50 
 
 
329 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  47.66 
 
 
472 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  47.81 
 
 
452 aa  279  7e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  46.11 
 
 
322 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  49.4 
 
 
317 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  47.52 
 
 
447 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.52 
 
 
343 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  48.1 
 
 
420 aa  276  4e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.48 
 
 
331 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  48.93 
 
 
329 aa  275  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  45.78 
 
 
353 aa  275  8e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  43.88 
 
 
335 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  43.88 
 
 
335 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.78 
 
 
353 aa  275  9e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  43.99 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  50.16 
 
 
441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  44.28 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  47.25 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  43.88 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  46.39 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  43.88 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  44.68 
 
 
331 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2418  NADH dehydrogenase subunit H  44.68 
 
 
330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.68011  normal  0.208608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  44.38 
 
 
331 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  47.3 
 
 
342 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  45.45 
 
 
325 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 
325 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  43.45 
 
 
369 aa  270  2e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  45.45 
 
 
325 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  45.45 
 
 
325 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.01 
 
 
360 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  45.45 
 
 
325 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  45.45 
 
 
325 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  45.45 
 
 
325 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  45.45 
 
 
325 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0590  NADH dehydrogenase subunit H  49.19 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  46.18 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  45.05 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  44.44 
 
 
325 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  44.44 
 
 
325 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  48.2 
 
 
341 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  44.44 
 
 
325 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0579  NADH dehydrogenase subunit H  48.86 
 
 
347 aa  270  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.302811  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  44.44 
 
 
325 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  44.44 
 
 
325 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  43.39 
 
 
352 aa  269  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  42.56 
 
 
367 aa  268  2e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28500  NADH dehydrogenase subunit H  44.88 
 
 
329 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  46.06 
 
 
338 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  43.58 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  44.51 
 
 
448 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  46.25 
 
 
457 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  44.18 
 
 
324 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  45.54 
 
 
348 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>