More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4058 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  95.09 
 
 		 448 aa  822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 447 aa  883    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  62.39 
 
 		 447 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  58.41 
 
 		 486 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  56.52 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  53.64 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  53.61 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  54.2 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  53.32 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  54.72 
 
 		 413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  54.71 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  54.71 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  53.6 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  55.77 
 
 		 411 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  54.89 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  53.29 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  51.75 
 
 		 472 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  53.56 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  51.25 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  51.58 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  55.8 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  48.4 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  51.64 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  54.05 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  58.43 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  55.87 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  53.83 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  49.1 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  50.59 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  54.78 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  45.92 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  48.14 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.4 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.56 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.54 
 
 		 348 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.23 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  45.74 
 
 		 349 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  50.16 
 
 		 341 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.14 
 
 		 337 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.52 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  41.74 
 
 		 369 aa  286  5.999999999999999e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.4 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  42.36 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  44.27 
 
 		 415 aa  282  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.76 
 
 		 329 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  44.41 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.1 
 
 		 329 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  44.89 
 
 		 417 aa  279  7e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  47.11 
 
 		 330 aa  279  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  44.92 
 
 		 338 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  43.23 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.19 
 
 		 357 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  41.21 
 
 		 367 aa  275  8e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  44.75 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  43.93 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.69 
 
 		 349 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.66 
 
 		 343 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.03 
 
 		 331 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.43 
 
 		 347 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  44.1 
 
 		 358 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  47.37 
 
 		 329 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  44.58 
 
 		 354 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  45.43 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  44.89 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  44.89 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  41.95 
 
 		 354 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 		 322 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1290  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.34 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  44.93 
 
 		 348 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.73 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.53 
 
 		 354 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  42.07 
 
 		 357 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  41.78 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.54 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  42.24 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  41.3 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.38 
 
 		 358 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  40.92 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  41.01 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.71 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  42.9 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 		 358 aa  263  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  43.02 
 
 		 354 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 		 347 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  44.14 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  42.46 
 
 		 356 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.17 
 
 		 347 aa  262  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  43.52 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  43.38 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  43.6 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>