More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3222 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 441 aa  868    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  70.36 
 
 		 458 aa  612  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  68.97 
 
 		 436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  71.22 
 
 		 447 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  66.59 
 
 		 445 aa  534  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  60.59 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  55.74 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  58.39 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  56.77 
 
 		 472 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  56.72 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  54.25 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  54.81 
 
 		 416 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  54.81 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  57 
 
 		 411 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  54.81 
 
 		 416 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  57.71 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  52.64 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  60.35 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  53.12 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  56.23 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  50.32 
 
 		 486 aa  415  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  52.79 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  52.16 
 
 		 452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  53.09 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  54.55 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  49.1 
 
 		 447 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  51.77 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  49.2 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  48.65 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  48.54 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  49.29 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.51 
 
 		 364 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.41 
 
 		 349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  49.11 
 
 		 349 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.92 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.49 
 
 		 349 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.87 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  51.42 
 
 		 329 aa  299  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  46.53 
 
 		 367 aa  299  8e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  46.67 
 
 		 369 aa  298  2e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.61 
 
 		 329 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  47.11 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.16 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  50.46 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  50.46 
 
 		 330 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  46.94 
 
 		 417 aa  289  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.04 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  46.02 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.39 
 
 		 343 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  47.55 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  46.91 
 
 		 341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  46.6 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  46.96 
 
 		 354 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  46.42 
 
 		 338 aa  282  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  45.29 
 
 		 415 aa  282  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  46.67 
 
 		 354 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  45.61 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  48.54 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  47.23 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  46.53 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.97 
 
 		 354 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  45.09 
 
 		 322 aa  279  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.01 
 
 		 331 aa  279  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.01 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  46.59 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.21 
 
 		 347 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  44.86 
 
 		 349 aa  274  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  45 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.63 
 
 		 341 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.1 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.63 
 
 		 341 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  45.54 
 
 		 341 aa  272  9e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.48 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.43 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  44.71 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  46.02 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  44.88 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  47.13 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.13 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.53 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  45.13 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  46.09 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  42.64 
 
 		 345 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  42.9 
 
 		 348 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.74 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  43.47 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  44.04 
 
 		 353 aa  266  8e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  45.27 
 
 		 352 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  46.95 
 
 		 343 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  43.66 
 
 		 384 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.41 
 
 		 339 aa  264  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  44.79 
 
 		 355 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  45.09 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.02 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.64 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  45.09 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.4 
 
 		 353 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  43.15 
 
 		 352 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  43.15 
 
 		 352 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>