More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5105 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
384 aa  777    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  72.29 
 
 
359 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  66.09 
 
 
345 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  60.97 
 
 
345 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  63.94 
 
 
350 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  64.53 
 
 
342 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  48.84 
 
 
349 aa  338  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.42 
 
 
349 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  48.55 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.29 
 
 
348 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.43 
 
 
337 aa  316  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  46.69 
 
 
390 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  45.24 
 
 
364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 
341 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.19 
 
 
329 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  46.11 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  46.15 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.22 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  43.97 
 
 
390 aa  303  5.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  43.32 
 
 
330 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  43.85 
 
 
357 aa  296  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  44.28 
 
 
372 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  43.64 
 
 
329 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  45.54 
 
 
407 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.77 
 
 
331 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  44.06 
 
 
330 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.35 
 
 
354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  44.06 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  43.43 
 
 
372 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  43.06 
 
 
384 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  43.12 
 
 
372 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  43.07 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  43.69 
 
 
372 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  43.34 
 
 
384 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  44.34 
 
 
372 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 
372 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  44.34 
 
 
372 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  44.74 
 
 
441 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  44.34 
 
 
372 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  43.07 
 
 
372 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  43.08 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  41.49 
 
 
372 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  39.89 
 
 
410 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  43.37 
 
 
322 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  42 
 
 
447 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4516  NADH dehydrogenase (quinone)  40.72 
 
 
373 aa  272  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  43.91 
 
 
472 aa  272  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  43.44 
 
 
341 aa  271  1e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  42.94 
 
 
353 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1693  NADH dehydrogenase subunit H  45.17 
 
 
348 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.24 
 
 
336 aa  271  2e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  39.28 
 
 
451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  42.95 
 
 
449 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  45.06 
 
 
367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.15 
 
 
329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0635  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.05 
 
 
389 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.05 
 
 
389 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3186  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.05 
 
 
389 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  42.6 
 
 
348 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  39.53 
 
 
438 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  43.1 
 
 
369 aa  268  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 
372 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  42.72 
 
 
372 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  42.94 
 
 
340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  43.28 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.29 
 
 
348 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  42.31 
 
 
462 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  41.74 
 
 
353 aa  266  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  40.16 
 
 
415 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  41.74 
 
 
353 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  42.82 
 
 
441 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  41.87 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  45.79 
 
 
333 aa  265  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  41.96 
 
 
372 aa  265  8e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 
333 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 
333 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 
333 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 
333 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 
333 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 
333 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 
333 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 
333 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  45.48 
 
 
333 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  44.41 
 
 
333 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  42.09 
 
 
316 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  41.64 
 
 
436 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  41.19 
 
 
340 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  43.26 
 
 
486 aa  262  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  44.41 
 
 
333 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.77 
 
 
389 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  43.2 
 
 
318 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.19 
 
 
343 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.2 
 
 
344 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  38.8 
 
 
413 aa  260  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  40.57 
 
 
328 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.01 
 
 
372 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.38 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0280  NADH dehydrogenase subunit H  44.12 
 
 
373 aa  259  6e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
372 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>