More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0288 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  68.37 
 
 
448 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  100 
 
 
452 aa  904    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  60.53 
 
 
438 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  59.34 
 
 
430 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  56 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  57.37 
 
 
486 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  56.15 
 
 
416 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  56.15 
 
 
416 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  56.15 
 
 
416 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  57.08 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  53.32 
 
 
447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  58.37 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  64.19 
 
 
411 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  54.55 
 
 
451 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  55.58 
 
 
413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  54.59 
 
 
447 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  55.02 
 
 
457 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  52.54 
 
 
448 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  51.74 
 
 
472 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  51.88 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  53.77 
 
 
449 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  56.37 
 
 
462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  52.44 
 
 
449 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  53.81 
 
 
466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  49.67 
 
 
441 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  50.59 
 
 
447 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  48.67 
 
 
436 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  49.55 
 
 
447 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  50.47 
 
 
445 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  48.54 
 
 
441 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  48.14 
 
 
420 aa  333  4e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  51.56 
 
 
341 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.43 
 
 
364 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  47.51 
 
 
349 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.65 
 
 
349 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  47.65 
 
 
349 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.02 
 
 
348 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.15 
 
 
337 aa  296  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.87 
 
 
329 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.83 
 
 
354 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.23 
 
 
331 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.96 
 
 
330 aa  286  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.52 
 
 
329 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  44.38 
 
 
417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.24 
 
 
389 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  40.92 
 
 
367 aa  280  5e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.22 
 
 
337 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
415 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  42.5 
 
 
342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  40.59 
 
 
369 aa  273  5.000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.48 
 
 
330 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  45.21 
 
 
317 aa  272  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  45.19 
 
 
330 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.9 
 
 
343 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
354 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  46.25 
 
 
319 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  40.25 
 
 
353 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 
329 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  43.02 
 
 
354 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  42.56 
 
 
322 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  43.02 
 
 
354 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  44.89 
 
 
357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  42.09 
 
 
345 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  41.18 
 
 
341 aa  266  7e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  45.93 
 
 
323 aa  266  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  39.49 
 
 
353 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  44.2 
 
 
341 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.75 
 
 
339 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.06 
 
 
341 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  42.73 
 
 
354 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.06 
 
 
341 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  43.02 
 
 
353 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.02 
 
 
344 aa  264  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  42.78 
 
 
390 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1290  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.74 
 
 
426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.673572  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  43.43 
 
 
341 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  40.7 
 
 
354 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.36 
 
 
339 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.94 
 
 
366 aa  258  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 
338 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.57 
 
 
358 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  41.35 
 
 
325 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  41.35 
 
 
325 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  41.35 
 
 
325 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  41.35 
 
 
325 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  41.35 
 
 
325 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.28 
 
 
348 aa  255  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  40.29 
 
 
352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.52 
 
 
358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  41.06 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  40.06 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  40.63 
 
 
354 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  41.98 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.77 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  44.54 
 
 
363 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.11 
 
 
359 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  41.62 
 
 
391 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  40.29 
 
 
359 aa  252  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  40.79 
 
 
340 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  39.69 
 
 
350 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>