More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2709 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 458 aa  903    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  73.68 
 
 		 436 aa  616  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  75.85 
 
 		 447 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  70.36 
 
 		 441 aa  586  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  71.67 
 
 		 445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  59.46 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  56.64 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  53.6 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  57.63 
 
 		 449 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  57 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  54.92 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  54.92 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  55.16 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  56.28 
 
 		 410 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  55.37 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  56.64 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  53.47 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  53.12 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  54.96 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  50.45 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  51.58 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  58.87 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  56.26 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  52.24 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  52.83 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  53.38 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  49.53 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  57.7 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  58.2 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  59.64 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.79 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  46.51 
 
 		 341 aa  310  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  47.29 
 
 		 369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.04 
 
 		 337 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.78 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  48.78 
 
 		 349 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  46.55 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  44.09 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  46.22 
 
 		 420 aa  300  5e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.53 
 
 		 389 aa  299  9e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.52 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.52 
 
 		 337 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.04 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.47 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  45.78 
 
 		 341 aa  292  7e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  45.88 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.2 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  46.02 
 
 		 415 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  48.58 
 
 		 330 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.95 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.86 
 
 		 354 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  44.67 
 
 		 354 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  44.67 
 
 		 354 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  44.86 
 
 		 357 aa  282  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  43.55 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  44.38 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  46.93 
 
 		 329 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  46.34 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.67 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.67 
 
 		 344 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  47.57 
 
 		 390 aa  276  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  44.79 
 
 		 342 aa  276  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  45.43 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.82 
 
 		 353 aa  274  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  41.83 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  44.04 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  46.35 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  45.34 
 
 		 355 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.78 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.67 
 
 		 349 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  45.02 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  46.77 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.22 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  43.53 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.53 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  44 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  44.71 
 
 		 352 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  44.72 
 
 		 355 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  44.71 
 
 		 352 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  44.71 
 
 		 352 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  44.72 
 
 		 355 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  44.71 
 
 		 354 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  44.71 
 
 		 333 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  44.71 
 
 		 354 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  44.71 
 
 		 354 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.45 
 
 		 330 aa  269  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  43.87 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  43.87 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  44.06 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  44.41 
 
 		 355 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  41.85 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  44.68 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  44.94 
 
 		 355 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  44.94 
 
 		 355 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  44.94 
 
 		 355 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  46.26 
 
 		 319 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  47.44 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.37 
 
 		 341 aa  266  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>