More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3388 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  93.33 
 
 		 391 aa  728    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 390 aa  771    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  60.6 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  55.12 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  47.46 
 
 		 341 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  44.41 
 
 		 359 aa  311  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  49.36 
 
 		 447 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 		 384 aa  305  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  46.83 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.19 
 
 		 330 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.05 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.05 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  45.94 
 
 		 364 aa  298  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  46.18 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  45.61 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.59 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.77 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  44.09 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  44.09 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  44.09 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  44.09 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  44.09 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  45.59 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  43.8 
 
 		 325 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  46.65 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  46.79 
 
 		 342 aa  292  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  43.95 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  48 
 
 		 411 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  45.24 
 
 		 329 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.74 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  44.41 
 
 		 449 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  45.38 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.39 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  47.4 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 325 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  42.94 
 
 		 325 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 325 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 325 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.76 
 
 		 329 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 325 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 325 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 325 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 325 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  43.06 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.11 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  45.51 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  47.53 
 
 		 462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.62 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  42.65 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  45.99 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  46.75 
 
 		 410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  45.4 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  46.6 
 
 		 416 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  46.6 
 
 		 416 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  43.68 
 
 		 353 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  46.6 
 
 		 416 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  43.49 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  43.87 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  44.44 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  44.72 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  45.8 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  43.79 
 
 		 420 aa  279  5e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  43.39 
 
 		 353 aa  278  8e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  40.72 
 
 		 486 aa  278  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3302  NADH dehydrogenase subunit H  43.41 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  46.53 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  47.57 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02167  hypothetical protein  42.39 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  43.97 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  46.48 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  47.73 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1810  NADH dehydrogenase subunit H  43.41 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1460  NADH dehydrogenase subunit H  43.41 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  41.33 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  42 
 
 		 335 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  48.23 
 
 		 436 aa  273  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  47.1 
 
 		 447 aa  272  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  41.13 
 
 		 341 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  41.13 
 
 		 341 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1566  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 		 325 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  42.29 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  43.67 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1400  NADH dehydrogenase subunit H  43.11 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  45.76 
 
 		 338 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  40.48 
 
 		 390 aa  269  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 317 aa  269  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  44.04 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  42.29 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  43.73 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  42.52 
 
 		 348 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  42 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.39 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  41.02 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  45.6 
 
 		 438 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  45.81 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  41.93 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  41.93 
 
 		 335 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  41.02 
 
 		 355 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>