More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4551 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
486 aa  956    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  63.27 
 
 
447 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  58.14 
 
 
448 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  58.46 
 
 
447 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  58.69 
 
 
433 aa  495  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  59.7 
 
 
447 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  59.86 
 
 
430 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  62.03 
 
 
416 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  69.34 
 
 
451 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  62.03 
 
 
416 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  62.03 
 
 
416 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  63.27 
 
 
462 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  53.56 
 
 
448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  59.53 
 
 
410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0545  NADH dehydrogenase subunit H  58.35 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  54.26 
 
 
438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  54.7 
 
 
472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  57.37 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  57.11 
 
 
413 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  55.93 
 
 
466 aa  465  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  56.95 
 
 
411 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  59.29 
 
 
449 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  50.84 
 
 
441 aa  435  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2688  NADH dehydrogenase subunit H  53.29 
 
 
452 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.18486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  50.76 
 
 
458 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  52.86 
 
 
447 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  51.36 
 
 
457 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  48.94 
 
 
436 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  60.29 
 
 
441 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0546  NADH dehydrogenase subunit H  50.11 
 
 
445 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.714714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  53.27 
 
 
420 aa  351  2e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  51.17 
 
 
341 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  48.31 
 
 
364 aa  316  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  47.58 
 
 
349 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.02 
 
 
348 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.26 
 
 
349 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  48.2 
 
 
357 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.73 
 
 
389 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.95 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.3 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  48.8 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.96 
 
 
349 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.96 
 
 
329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  45.43 
 
 
415 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.93 
 
 
330 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  48.22 
 
 
330 aa  299  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  45.13 
 
 
330 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  46.32 
 
 
341 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  49.42 
 
 
354 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  46.32 
 
 
341 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.8 
 
 
344 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  49.13 
 
 
352 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  49.13 
 
 
354 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  49.13 
 
 
352 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  49.13 
 
 
354 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  49.13 
 
 
352 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  49.13 
 
 
354 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  48.53 
 
 
333 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.79 
 
 
349 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.47 
 
 
337 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  49.4 
 
 
355 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  49.4 
 
 
355 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 
322 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.71 
 
 
348 aa  287  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  49.11 
 
 
355 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  49.1 
 
 
354 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  49.11 
 
 
355 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  46.09 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  44.27 
 
 
342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  48.62 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.7 
 
 
357 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  43.27 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  43.23 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  48.8 
 
 
354 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.2 
 
 
339 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  45.88 
 
 
357 aa  282  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  49.22 
 
 
355 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  49.22 
 
 
355 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  49.22 
 
 
355 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  46.74 
 
 
417 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  43.45 
 
 
349 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.3 
 
 
331 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  42.41 
 
 
345 aa  279  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  43.53 
 
 
341 aa  278  1e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  40.54 
 
 
390 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.38 
 
 
347 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.7 
 
 
343 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  44.28 
 
 
354 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  44.87 
 
 
354 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  44.87 
 
 
354 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.51 
 
 
339 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.83 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  42.74 
 
 
353 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  44.38 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.83 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 
358 aa  274  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.08 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.08 
 
 
340 aa  273  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  41.84 
 
 
353 aa  273  6e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>