More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1121 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 319 aa  625  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  73.94 
 
 		 317 aa  478  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  65.92 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  70.34 
 
 		 323 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3126  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  65.85 
 
 		 328 aa  414  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  66.13 
 
 		 318 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  60.69 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  67.53 
 
 		 317 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  66.78 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  63.42 
 
 		 335 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  62.42 
 
 		 335 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  62.79 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  63.09 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  60.4 
 
 		 321 aa  391  1e-108  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  62.13 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  60.65 
 
 		 325 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  61.46 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  61.46 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  62.42 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  62.08 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  61.46 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  62.08 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  60.06 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  61.46 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  61.46 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  61.46 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  62.42 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  61.46 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  61.46 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  59.74 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  59.68 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  59.68 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  59.68 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  59.68 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  59.68 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2418  NADH dehydrogenase subunit H  61.24 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.68011  normal  0.208608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28500  NADH dehydrogenase subunit H  64.43 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0590  NADH dehydrogenase subunit H  58.22 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1460  NADH dehydrogenase subunit H  60.75 
 
 		 325 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0579  NADH dehydrogenase subunit H  57.89 
 
 		 347 aa  374  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.302811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3302  NADH dehydrogenase subunit H  61.43 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1810  NADH dehydrogenase subunit H  60.75 
 
 		 325 aa  374  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639781 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1693  NADH dehydrogenase subunit H  59.27 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02167  hypothetical protein  61.59 
 
 		 327 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1566  NADH dehydrogenase subunit H  60.41 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1400  NADH dehydrogenase subunit H  61.97 
 
 		 324 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2544  NADH dehydrogenase subunit H  60.21 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1353  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  60.54 
 
 		 319 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1332  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.94 
 
 		 319 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  58.5 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4737  NADH dehydrogenase (quinone)  61.92 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.17 
 
 		 329 aa  342  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  55.48 
 
 		 329 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  54.77 
 
 		 330 aa  332  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4065  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.84 
 
 		 324 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0444558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  51.88 
 
 		 341 aa  330  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  55.16 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  55.96 
 
 		 330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  54.55 
 
 		 331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1742  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.82 
 
 		 318 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0161254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  56.45 
 
 		 353 aa  318  5e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0106  putative NADH dehydrogenase I chain H  58.46 
 
 		 318 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  55.48 
 
 		 353 aa  316  4e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  55.4 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1695  NADH dehydrogenase (quinone)  58.01 
 
 		 304 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.0025086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.33 
 
 		 348 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.33 
 
 		 343 aa  301  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  50.52 
 
 		 333 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  51.75 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  46.37 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.28 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  49.65 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  47.63 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  45.71 
 
 		 451 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  51.52 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  48.51 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  49.66 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  46.52 
 
 		 438 aa  285  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.52 
 
 		 337 aa  285  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.05 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.51 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  46.65 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  45.67 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  47.28 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  47.22 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.05 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  46.89 
 
 		 349 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.85 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  47.27 
 
 		 348 aa  278  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  45.28 
 
 		 462 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  45.31 
 
 		 349 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>