More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3126 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3126  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
328 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  72.21 
 
 
335 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  72.21 
 
 
335 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  71.77 
 
 
335 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  71.47 
 
 
335 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  72.21 
 
 
335 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  71.25 
 
 
331 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  71.25 
 
 
331 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  72.55 
 
 
322 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  71.9 
 
 
335 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  71.9 
 
 
335 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2418  NADH dehydrogenase subunit H  73.62 
 
 
330 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.68011  normal  0.208608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  72.59 
 
 
325 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  72.59 
 
 
325 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  72.59 
 
 
325 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  72.59 
 
 
325 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  72.59 
 
 
325 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  71.34 
 
 
325 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  70.4 
 
 
324 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  70.72 
 
 
324 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  70.72 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  70.72 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  70.72 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  70.72 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  70.72 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  70.72 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  70.72 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  70.72 
 
 
325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28500  NADH dehydrogenase subunit H  72.09 
 
 
329 aa  461  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1460  NADH dehydrogenase subunit H  70.49 
 
 
325 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1810  NADH dehydrogenase subunit H  70.49 
 
 
325 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.639781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1566  NADH dehydrogenase subunit H  70.16 
 
 
325 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3302  NADH dehydrogenase subunit H  70.49 
 
 
325 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1400  NADH dehydrogenase subunit H  70.82 
 
 
324 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02167  hypothetical protein  69.74 
 
 
327 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0590  NADH dehydrogenase subunit H  66.87 
 
 
347 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0579  NADH dehydrogenase subunit H  66.56 
 
 
347 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.302811  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  67.53 
 
 
321 aa  440  9.999999999999999e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2544  NADH dehydrogenase subunit H  68.2 
 
 
324 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38434  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1693  NADH dehydrogenase subunit H  66.04 
 
 
348 aa  424  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  62.73 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  65 
 
 
316 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  65.85 
 
 
319 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  63.84 
 
 
318 aa  391  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  65.86 
 
 
323 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  61.26 
 
 
318 aa  368  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  62.5 
 
 
317 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.68 
 
 
329 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  53.69 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4737  NADH dehydrogenase (quinone)  53.94 
 
 
319 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1353  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.79 
 
 
319 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1332  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.46 
 
 
319 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  51.97 
 
 
329 aa  298  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  46.69 
 
 
341 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.99 
 
 
331 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  49.68 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.68 
 
 
330 aa  285  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  49.5 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1742  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.19 
 
 
318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0161254  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0106  putative NADH dehydrogenase I chain H  54.81 
 
 
318 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  50.35 
 
 
353 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  49.31 
 
 
353 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.28 
 
 
337 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.74 
 
 
343 aa  278  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  47.7 
 
 
353 aa  278  7e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  48.14 
 
 
333 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4065  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.47 
 
 
324 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0444558  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.06 
 
 
344 aa  275  9e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  48.14 
 
 
333 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  48.79 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  47.8 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.81 
 
 
360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1695  NADH dehydrogenase (quinone)  53.57 
 
 
304 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.0025086  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 
338 aa  271  9e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.24 
 
 
358 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.89 
 
 
348 aa  269  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1156  NADH dehydrogenase (quinone)  43.79 
 
 
348 aa  269  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.87 
 
 
339 aa  268  8.999999999999999e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  42.35 
 
 
390 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.24 
 
 
347 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  43.08 
 
 
354 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  44.81 
 
 
451 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.05 
 
 
358 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  47.62 
 
 
322 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.81 
 
 
389 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  42.77 
 
 
391 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.84 
 
 
359 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  45.31 
 
 
420 aa  258  8e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  42.72 
 
 
352 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  42.51 
 
 
341 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  42.51 
 
 
341 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  45.82 
 
 
449 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>