More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3819 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 318 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  68.3 
 
 		 317 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  66.67 
 
 		 316 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  69.31 
 
 		 319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  65.17 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3126  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  62.85 
 
 		 328 aa  384  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  62.05 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  62.5 
 
 		 317 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  60.07 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  57.99 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  57.19 
 
 		 325 aa  363  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  60.47 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  58.17 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  60.47 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  59.32 
 
 		 335 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0590  NADH dehydrogenase subunit H  57.86 
 
 		 347 aa  359  3e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.148656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  58.98 
 
 		 335 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0579  NADH dehydrogenase subunit H  57.53 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.302811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  59.46 
 
 		 335 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  59.46 
 
 		 335 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  58.72 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  56.44 
 
 		 324 aa  352  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1693  NADH dehydrogenase subunit H  56.95 
 
 		 348 aa  351  7e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2418  NADH dehydrogenase subunit H  57.23 
 
 		 330 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.68011  normal  0.208608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  55.62 
 
 		 331 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  55.62 
 
 		 331 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  55.78 
 
 		 324 aa  349  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28500  NADH dehydrogenase subunit H  59.66 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02167  hypothetical protein  57.34 
 
 		 327 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  55.05 
 
 		 329 aa  341  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1460  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1810  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1400  NADH dehydrogenase subunit H  57.89 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1566  NADH dehydrogenase subunit H  57.19 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2544  NADH dehydrogenase subunit H  57.89 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.41 
 
 		 329 aa  335  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3302  NADH dehydrogenase subunit H  54.9 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  51.72 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  54 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1332  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.36 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1353  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.55 
 
 		 319 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4737  NADH dehydrogenase (quinone)  56.62 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  52.6 
 
 		 330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  52.92 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4065  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.74 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0444558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  49.53 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  50.32 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.34 
 
 		 348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0106  putative NADH dehydrogenase I chain H  55.52 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1742  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.17 
 
 		 318 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0161254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.22 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  49.67 
 
 		 353 aa  294  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  50 
 
 		 353 aa  293  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  47.06 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  49.67 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  46.75 
 
 		 349 aa  291  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.73 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.08 
 
 		 337 aa  287  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1695  NADH dehydrogenase (quinone)  53.74 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.0025086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.37 
 
 		 349 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.1 
 
 		 329 aa  285  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  49.83 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  48.63 
 
 		 333 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 		 333 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  48.81 
 
 		 333 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  46.44 
 
 		 451 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  48.46 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  48.46 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  48.12 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  48.46 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  48.46 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  48.46 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  48.46 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  48.79 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 349 aa  278  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  47.46 
 
 		 333 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 		 352 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.9 
 
 		 344 aa  272  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  48.49 
 
 		 447 aa  271  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  42.69 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  46.03 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  43.45 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  47.6 
 
 		 447 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.5 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  44.41 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  46.82 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.63 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>