More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3409 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 		 333 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  82.58 
 
 		 333 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  78.98 
 
 		 333 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  78.68 
 
 		 333 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.7 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.79 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  54.17 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.95 
 
 		 329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  51.95 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  50.65 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  50 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.85 
 
 		 329 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  49.68 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.82 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.85 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.62 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  48.59 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.33 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  51.86 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.51 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  47.5 
 
 		 349 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.35 
 
 		 337 aa  288  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  46.88 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  51.31 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  49.2 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  49.2 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  47.26 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  48.92 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  49.38 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  48.61 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  50.67 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  50 
 
 		 340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  50.52 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.95 
 
 		 344 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  49.35 
 
 		 329 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  44.29 
 
 		 372 aa  279  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  46.75 
 
 		 410 aa  278  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  45.56 
 
 		 372 aa  278  8e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  46.58 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  46.58 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  48.1 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  50.97 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  44.21 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3126  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.79 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  45.27 
 
 		 416 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  47.55 
 
 		 430 aa  275  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  45.27 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  45.27 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  44.21 
 
 		 349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  50.54 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  49.04 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  46.27 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  48.33 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  48.33 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.36 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  46.45 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  44.29 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  47.27 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  47.77 
 
 		 340 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  48.75 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  44.24 
 
 		 462 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  46.45 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  48.7 
 
 		 316 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  42.94 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  45.81 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  45.81 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  45.81 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  45.81 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  45.81 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  48.09 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4065  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.82 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0444558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  48.09 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  45.34 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  45.34 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  45.34 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  45.34 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  45.34 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  45.34 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  45.34 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  45.34 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.04 
 
 		 349 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  49.83 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  50.17 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  44.22 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  49.67 
 
 		 354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  49.67 
 
 		 354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  49.67 
 
 		 354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  49.5 
 
 		 355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  49.5 
 
 		 355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  46.18 
 
 		 486 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>