More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0927 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  100 
 
 		 353 aa  692    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  96.6 
 
 		 353 aa  677    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  94.9 
 
 		 353 aa  670    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  54.58 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.62 
 
 		 329 aa  328  8e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.59 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.85 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  50.63 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  50.49 
 
 		 329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  46.88 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  47.29 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  48.89 
 
 		 317 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  56.3 
 
 		 317 aa  301  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  49.19 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  55.52 
 
 		 319 aa  300  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  50.83 
 
 		 333 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.29 
 
 		 349 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 333 aa  299  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 		 333 aa  299  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  49.83 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  44.98 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  49.04 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  51.71 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.69 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  47.39 
 
 		 348 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  48.41 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  46.05 
 
 		 440 aa  295  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  51.96 
 
 		 316 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.59 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  46.81 
 
 		 451 aa  292  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  46.69 
 
 		 322 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.81 
 
 		 349 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  52.8 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  52.8 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  52.8 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  52.8 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  52.8 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  52.8 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  52.8 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  52.8 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  51.62 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  50.64 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  46.71 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  48.91 
 
 		 333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  47.54 
 
 		 329 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  44.38 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.01 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  47.62 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  51.05 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  51.05 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  51.05 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  51.05 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  51.05 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  42.54 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  49.66 
 
 		 318 aa  280  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  46.5 
 
 		 416 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  46.5 
 
 		 416 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  46.5 
 
 		 416 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  46.75 
 
 		 449 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  43.39 
 
 		 390 aa  278  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  46.08 
 
 		 462 aa  278  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  47.65 
 
 		 420 aa  278  9e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3126  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.43 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  47.08 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  45.62 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  50 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  45.59 
 
 		 413 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  44.85 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  48.64 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  44.98 
 
 		 410 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  47.4 
 
 		 367 aa  275  7e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  51.03 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.78 
 
 		 389 aa  275  9e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  44.82 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  47.19 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02167  hypothetical protein  51.99 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  45.54 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  45.75 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  45.75 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  43.77 
 
 		 447 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  49.3 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  49.3 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.2 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  47.26 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  43.84 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.32 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  47.26 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1332  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  48.81 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.37 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1053  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.28 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2994  NADH dehydrogenase (quinone)  43.37 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.960029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>