More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0811 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  94.9 
 
 
353 aa  670    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  95.75 
 
 
353 aa  671    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
353 aa  690    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  55.52 
 
 
348 aa  346  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  51.6 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.68 
 
 
349 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.2 
 
 
331 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  50.95 
 
 
330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  52.13 
 
 
329 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  48.96 
 
 
364 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50 
 
 
337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  49.36 
 
 
317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  49.84 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.07 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  56.84 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  52.16 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  51.83 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  51.83 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  51.83 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  56.3 
 
 
317 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  51.83 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  51.83 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  51.83 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  51.83 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  51.83 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  51.83 
 
 
333 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  44.78 
 
 
349 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  46.99 
 
 
349 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  51.16 
 
 
333 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  48.37 
 
 
348 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  52.4 
 
 
333 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  46.59 
 
 
440 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  50.32 
 
 
330 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.84 
 
 
329 aa  298  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  49.68 
 
 
330 aa  298  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  53.18 
 
 
316 aa  296  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  47.68 
 
 
322 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  48.02 
 
 
451 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.83 
 
 
349 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  52.71 
 
 
351 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  45.81 
 
 
391 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  47.9 
 
 
329 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.5 
 
 
354 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  48.54 
 
 
449 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  52.1 
 
 
325 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  52.1 
 
 
325 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  52.1 
 
 
325 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  52.1 
 
 
325 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  52.1 
 
 
325 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  52.1 
 
 
325 aa  286  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  52.1 
 
 
325 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  52.1 
 
 
325 aa  286  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  49.84 
 
 
333 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 
452 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  47.11 
 
 
410 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  45.82 
 
 
447 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  50 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  45.4 
 
 
390 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  48.12 
 
 
462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  50.32 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  47.58 
 
 
416 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  44.24 
 
 
416 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  44.24 
 
 
416 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  45.9 
 
 
411 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  51.05 
 
 
325 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3126  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.35 
 
 
328 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  49.32 
 
 
318 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  43.58 
 
 
438 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  48.75 
 
 
441 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2709  NADH dehydrogenase (quinone)  46.34 
 
 
458 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 
325 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 
325 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 
325 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 
325 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  51.4 
 
 
325 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1114  NADH dehydrogenase subunit H  51.7 
 
 
323 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0881  NADH dehydrogenase (quinone)  48.98 
 
 
336 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000223152  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  50.7 
 
 
321 aa  277  2e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  47.96 
 
 
420 aa  276  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  46.51 
 
 
354 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  45.43 
 
 
413 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  46.51 
 
 
354 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  49.49 
 
 
328 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.24 
 
 
344 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  47.08 
 
 
436 aa  276  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2994  NADH dehydrogenase (quinone)  43.24 
 
 
452 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.960029  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  45.51 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  46.1 
 
 
369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  45.09 
 
 
430 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  43.6 
 
 
447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  45.51 
 
 
367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1332  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.74 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.39 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.26 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  50 
 
 
324 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 
433 aa  273  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  43.81 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  41.32 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1498  NADH dehydrogenase subunit H  50 
 
 
324 aa  272  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  43.2 
 
 
354 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>