More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2994 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  91.59 
 
 		 452 aa  833    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2994  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 452 aa  891    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.960029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  52.16 
 
 		 440 aa  441  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  48.99 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  43.24 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  43.37 
 
 		 353 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.07 
 
 		 348 aa  282  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  43.09 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  39.59 
 
 		 357 aa  259  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  40.47 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  43.4 
 
 		 333 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  40.79 
 
 		 341 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  41.22 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  39.48 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 333 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 333 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 333 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 333 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 333 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  39.02 
 
 		 349 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 333 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  39.94 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  37.67 
 
 		 348 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  40 
 
 		 372 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.4 
 
 		 337 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  39.69 
 
 		 372 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  41.31 
 
 		 372 aa  247  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  37.02 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  40.43 
 
 		 390 aa  247  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  39.39 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  39.08 
 
 		 333 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  39.71 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  41.36 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  38.21 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  38.21 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  39.89 
 
 		 372 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.94 
 
 		 349 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  38.98 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  36.29 
 
 		 349 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  38.15 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  39.32 
 
 		 372 aa  241  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  40.34 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.71 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  37.3 
 
 		 330 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.93 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  39.62 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  38.92 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.81 
 
 		 329 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.52 
 
 		 354 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.27 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.29 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  37.76 
 
 		 341 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  40.51 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  38.14 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  37.6 
 
 		 330 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  36.51 
 
 		 372 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  40.45 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  38.1 
 
 		 372 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  40.17 
 
 		 354 aa  232  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  39.49 
 
 		 372 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  40.45 
 
 		 354 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  40.45 
 
 		 354 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  40.45 
 
 		 354 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  39.49 
 
 		 372 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  40.45 
 
 		 352 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  40.51 
 
 		 354 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  40.45 
 
 		 352 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  40.88 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  40.45 
 
 		 352 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  38.44 
 
 		 372 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  38.53 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1285  NADH dehydrogenase (quinone)  37.25 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.853788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  36 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  40.88 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  41.01 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  41.01 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  38.17 
 
 		 372 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  41.08 
 
 		 355 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  37.82 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  38.86 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  39.07 
 
 		 354 aa  230  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0476  NADH dehydrogenase (quinone)  36.62 
 
 		 436 aa  229  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.14 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  41.01 
 
 		 355 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  39.41 
 
 		 354 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  38.17 
 
 		 372 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  38.11 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3616  NADH dehydrogenase (quinone)  40.44 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.537864  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2575  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.39 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  41.84 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  41.84 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  41.84 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  35.81 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  36.54 
 
 		 372 aa  226  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  35.81 
 
 		 372 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07450  NADH dehydrogenase subunit H  34.02 
 
 		 447 aa  226  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0266396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.6 
 
 		 354 aa  226  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>