More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1603 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
372 aa  738    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  87.06 
 
 
372 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  85.71 
 
 
372 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  90.98 
 
 
368 aa  676    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  84.64 
 
 
372 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  84.64 
 
 
372 aa  630  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  82.21 
 
 
372 aa  618  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  51.82 
 
 
360 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3616  NADH dehydrogenase (quinone)  54.55 
 
 
361 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.537864  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  47.35 
 
 
365 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2575  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.55 
 
 
464 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1273  NADH dehydrogenase (quinone)  46.47 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1374  NADH dehydrogenase (quinone)  47.7 
 
 
464 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1285  NADH dehydrogenase (quinone)  46.44 
 
 
455 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.853788  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  47.13 
 
 
333 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.55 
 
 
348 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.04 
 
 
349 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  45.68 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1027  hypothetical protein  42.61 
 
 
351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  47.08 
 
 
341 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.81 
 
 
329 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.48 
 
 
349 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  44.59 
 
 
333 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  41.87 
 
 
349 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  41.11 
 
 
364 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  41.6 
 
 
349 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  44.86 
 
 
340 aa  262  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  44.86 
 
 
340 aa  262  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  43.63 
 
 
333 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
333 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  43.5 
 
 
348 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
333 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
333 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
333 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
333 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
333 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  42.99 
 
 
333 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.81 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  45.74 
 
 
340 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  39.41 
 
 
372 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0266  NADH dehydrogenase (quinone)  43.21 
 
 
419 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571273  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.06 
 
 
340 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  41.64 
 
 
349 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  42.46 
 
 
372 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.11 
 
 
339 aa  255  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  40.79 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  39.95 
 
 
452 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  41.36 
 
 
350 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  41.19 
 
 
322 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.99 
 
 
344 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  42.57 
 
 
341 aa  249  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  39.89 
 
 
372 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.65 
 
 
349 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  39.6 
 
 
372 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  41.31 
 
 
372 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  42.51 
 
 
345 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  39.11 
 
 
372 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  45.25 
 
 
338 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.19 
 
 
366 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  41.55 
 
 
363 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  38.34 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.05 
 
 
347 aa  246  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  41.55 
 
 
363 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  43 
 
 
413 aa  245  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  40.23 
 
 
384 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  41.42 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.02 
 
 
329 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  40.94 
 
 
372 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  39.42 
 
 
359 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  43.06 
 
 
363 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.18 
 
 
354 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  43.69 
 
 
352 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.09 
 
 
337 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  41.67 
 
 
342 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  44.41 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  44.41 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.45 
 
 
357 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  41.27 
 
 
341 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  41.74 
 
 
358 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.15 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  44.59 
 
 
353 aa  239  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.64 
 
 
360 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2994  NADH dehydrogenase (quinone)  39.69 
 
 
452 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.960029  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  40.81 
 
 
349 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  40.26 
 
 
372 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.53 
 
 
360 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 
357 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  40.26 
 
 
372 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  41.8 
 
 
354 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  40.26 
 
 
372 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.95 
 
 
339 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.75 
 
 
337 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  40.58 
 
 
372 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  40.95 
 
 
358 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.9 
 
 
359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  39.11 
 
 
372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  39.11 
 
 
372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>