More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4985 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 413 aa  826    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  48.25 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2994  NADH dehydrogenase (quinone)  48.99 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.960029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  48.07 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.59 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  45.9 
 
 		 353 aa  277  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  45.43 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.38 
 
 		 348 aa  263  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  41.16 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  44.9 
 
 		 341 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  42.24 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  41.28 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  42.64 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  41.1 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  38.79 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  40.46 
 
 		 372 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  40.52 
 
 		 372 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  40.63 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  38.95 
 
 		 372 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  43.71 
 
 		 329 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  40.35 
 
 		 349 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  41.77 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 		 372 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  40 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  39.08 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  40.75 
 
 		 372 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  39.54 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  45.27 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  39.14 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.94 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.85 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  38.35 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.58 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.32 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  43 
 
 		 372 aa  245  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  43 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  42.33 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.46 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  41.37 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0916  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41 
 
 		 389 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0945521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  41.18 
 
 		 330 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.38 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  44.26 
 
 		 333 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.29 
 
 		 331 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  41.35 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  43.48 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2563  NADH dehydrogenase subunit H  40.66 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  40.71 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0712  NADH dehydrogenase (quinone)  45.14 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  42.07 
 
 		 372 aa  240  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29930  NADH dehydrogenase subunit H  40.36 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 		 372 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  39.42 
 
 		 390 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  42.91 
 
 		 333 aa  239  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  40.41 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  41.04 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  43.75 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  38.4 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0749  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0374707  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  40.19 
 
 		 372 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  40.19 
 
 		 372 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1374  NADH dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1273  NADH dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1285  NADH dehydrogenase (quinone)  38.67 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.853788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  40.19 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2575  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.44 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  43.97 
 
 		 328 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  44.98 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  38.96 
 
 		 462 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  37.39 
 
 		 357 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  42.43 
 
 		 335 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  42.43 
 
 		 335 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  43.66 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  37.6 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  40.57 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.71 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 486 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  40.24 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  39.41 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  39.21 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4058  NADH dehydrogenase subunit H  38.33 
 
 		 447 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.97 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  37.46 
 
 		 354 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4456  NADH dehydrogenase subunit H  39.38 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  39.82 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.67 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  37.36 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  41.16 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1042  NADH dehydrogenase (quinone)  38.33 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  37.25 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  37.08 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>