More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1209 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  100 
 
 
349 aa  703    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  65.9 
 
 
349 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  54.47 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.73 
 
 
329 aa  325  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  324  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  319  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  319  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  319  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  319  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  52.9 
 
 
333 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  52.9 
 
 
333 aa  318  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  54.17 
 
 
333 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  48.43 
 
 
351 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  53.24 
 
 
333 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  46.79 
 
 
329 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  45.74 
 
 
348 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  45.83 
 
 
353 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.37 
 
 
337 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47 
 
 
344 aa  289  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  45.81 
 
 
353 aa  289  6e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  47.12 
 
 
340 aa  289  6e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.47 
 
 
340 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  45.51 
 
 
353 aa  288  7e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  44.14 
 
 
349 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  43.84 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  47.06 
 
 
341 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  47.06 
 
 
341 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.56 
 
 
329 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.15 
 
 
331 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  47.13 
 
 
352 aa  281  9e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 
341 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.02 
 
 
347 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  46.3 
 
 
338 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  43.49 
 
 
349 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.11 
 
 
343 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  44.91 
 
 
354 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  42.21 
 
 
440 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  45.31 
 
 
329 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  44.89 
 
 
358 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  45.51 
 
 
354 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  44.31 
 
 
355 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  46.37 
 
 
319 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  45.19 
 
 
355 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  44.87 
 
 
355 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.61 
 
 
366 aa  275  7e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
354 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  45.43 
 
 
354 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  44.87 
 
 
355 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
354 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
354 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  43.31 
 
 
354 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  43.25 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  43.79 
 
 
352 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  43.79 
 
 
352 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  44.04 
 
 
352 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  43.79 
 
 
352 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  45.17 
 
 
349 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  43.75 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.81 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  44.91 
 
 
372 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.47 
 
 
357 aa  272  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  45.07 
 
 
316 aa  272  7e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  46.53 
 
 
340 aa  272  7e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  46.53 
 
 
340 aa  272  7e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  42.64 
 
 
354 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  42.33 
 
 
354 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.81 
 
 
359 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  46.15 
 
 
355 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  46.15 
 
 
355 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  46.15 
 
 
355 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  43.8 
 
 
360 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  42.77 
 
 
354 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  46.98 
 
 
343 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.44 
 
 
349 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  42.78 
 
 
372 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  42.9 
 
 
357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  44.01 
 
 
317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  45.77 
 
 
354 aa  268  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  43.24 
 
 
364 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.89 
 
 
358 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  44.09 
 
 
372 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  43.87 
 
 
330 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  43.16 
 
 
354 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.89 
 
 
358 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.64 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  43.59 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  43.61 
 
 
372 aa  266  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  44.48 
 
 
341 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  44.37 
 
 
331 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  42.56 
 
 
451 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  42.46 
 
 
354 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  43.46 
 
 
322 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  46.13 
 
 
318 aa  265  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  44.89 
 
 
358 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  46.08 
 
 
337 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  43.67 
 
 
367 aa  263  2e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>